После углубленного анализа генетического материала сотен мазков, взятых со стен, полов, машин и стоков на оптовом рынке морепродуктов Хуанань в Ухане, Китай — месте, которое называют эпицентром раннего распространения COVID-19 — ученые утверждают, что теперь они точно знают, какие виды животных находились в том же районе, где исследователи также обнаружили больше всего положительных образцов вируса, вызывающего COVID-19.
Виды, обитающие в районах, где было обнаружено наибольшее количество образцов SARS-CoV-2, включают енотовидную собаку, седую бамбуковую крысу, собаку, европейского кролика, амурского ежа, малайского дикобраза, мунтжака Ривза, гималайского сурка и масковую пальмовую циветту.
Новые результаты дополняют убедительные, но косвенные доказательства того, что вирус SARS-CoV-2 передался от инфицированных животных к человеку и что рынок был центральным местом первоначального распространения.
Исследователи определили виды животных на рынке с помощью метода, называемого метагеномным секвенированием, который считывает весь генетический материал, присутствующий в образце, а затем анализирует его, чтобы понять, откуда он взялся.
Анализ, опубликованный в четверг в журнале Cell, не доказывает, что животные были инфицированы вирусом, но их ДНК была обнаружена очень близко к вирусу, иногда на том же тампоне. Это означает, что есть большая вероятность, что животные были инфицированы на рынке.
Из животных, присутствующих на рынке, кролики, собаки и енотовидные собаки известны своей восприимчивостью к инфекциям Covid-19. Было также показано, что енотовидные собаки переносят инфекцию, что делает их сильными кандидатами на роль животных, которые первыми передали вирус человеку.
Изучение возраста вирусов
Международная исследовательская группа, стоящая за исследованием, также использовала генетический материал из образцов, найденных на рынке, для проведения эволюционного анализа — метода, который помогает им оценить, когда впервые появился вирус и каково его ближайшее генетическое родство.
«По сути, это радиоуглеродное датирование вирусов», — сказал старший автор исследования доктор Кристиан Андерсен, который является директором отдела геномики инфекционных заболеваний в Институте трансляционных исследований Скриппса в Ла-Хойе, Калифорния.
Понимая, насколько быстро вирус, вызывающий COVID, изменяется или мутирует (он приобретает около двух генетических мутаций в месяц), можно приблизительно определить его возраст.
Исследователи полагают, что вирус, вызвавший пандемию, появился где-то между серединой ноября и серединой декабря 2019 года.
Их анализ показывает, что вирус SARS-CoV-2, присутствующий на рынке, появился в то же время, что и вирус более крупной пандемии, что позволяет предположить, что это одно и то же.
Если бы он сначала появился откуда-то еще, а затем попал на рынок, где его распространение усилилось — как предполагает теория утечки из лаборатории о происхождении Covid-19 — время появления вируса, обнаруженного на рынке, было бы иным, чем появление вируса, вызвавшего пандемию, сказал Андерсен. У пандемического вируса была бы более ранняя дата рождения.
Другие доказательства указывают в том же направлении.
Почти треть из первых 174 человек, заболевших COVID-19, имели связь с рынком, а многие другие, не имеющие прямой связи, жили недалеко от рынка, в городе с населением 12 миллионов человек.
Андерсен сказал, что когда он впервые увидел, насколько плотным было это скопление, «я был ошеломлен».
Когда он начал изучать результаты сотен мазков, взятых на рынке в январе 2020 года, «посмотрев на то, что на самом деле происходит внутри рынка, и увидев это скопление позитива в отношении окружающей среды, мой мозг буквально взорвался. Я подумал: «Не могу поверить в то, что я здесь вижу», — сказал Андерсен.
Еще одним важным признаком того, что пандемия могла начаться на рынке, является тот факт, что обе линии вируса, циркулировавшие с самых первых дней пандемии — линия «А» и линия «В», — присутствуют в мазках, собранных на рынке.
Накопление доказательств животного происхождения
Андерсен отметил, что ученые никогда не располагали таким объемом информации на таком уровне детализации ни по одной предыдущей пандемии.
Результаты тесно связаны с результатами аналогичного анализа, проведенного китайскими учеными и опубликованного в журнале Nature в 2023 году. Данные, использованные для проведения анализа, на короткое время стали предметом международной интриги, когда в марте 2023 года они были без лишнего шума опубликованы на GISAID — сайте, где ученые обмениваются генетическими последовательностями вирусов для проведения исследований.
Профессор Флоранс Дебарр, исследователь из Французского национального центра научных исследований, обнаружила данные в 2023 году и быстро оповестила других ученых. Она также является старшим автором в Andersen по этому новому исследованию.
«Это добавляет больше доказательств», — сказал Дебарре о новом исследовании. «Поскольку данные продолжают накапливаться, все результаты по-прежнему указывают на одно и то же, а именно на происхождение, связанное с торговлей дикими животными на рынке Хуанань».
Это исследование дополняет несколько важных научных статей той же исследовательской группы, опубликованных в крупных журналах, в которых указывается на животное происхождение начала пандемии COVID-19.
Андерсен знает, что многие увидят его имя в новом исследовании о происхождении пандемии Covid-19 и сразу же отвергнут его выводы. Он говорит, что ему все равно.
«Они просто посмотрят на список авторов в статье и скажут: «О, да, мы не можем доверять ничему из этого», верно? Так что нам даже не нужно читать статью», — сказал Андерсен.
Андерсен был одним из видных лидеров международной группы ученых, которые изучали научные доказательства, собранные в первые недели пандемии, пытаясь понять, как начался глобальный кризис общественного здравоохранения.
Андерсен оказался в центре внимания правительственных расследований и теорий заговора в социальных сетях, потому что он изменил свое мнение: изначально полагая, что SARS-CoV2 появился в лаборатории в Ухане, где манипулировали похожими вирусами, он опубликовал научную статью, в которой объяснял, почему вирус, вызвавший пандемию COVID-19, вероятно, произошел от животных, которые были инфицированы, а затем передали его людям — событие, называемое перетоком.
Большинство пандемий начинаются именно с таких случаев заражения животных.
Сторонники теории утечки из лаборатории полагают, что на Андерсена оказали давление ведущие ученые из Национальных институтов здравоохранения, чтобы он изменил свои взгляды.
Андерсен сказал, что все это неправда. Он просто сделал то, что делают ученые, когда им предъявляют доказательства, противоречащие их первоначальному мнению: он изменил свою гипотезу.
Дебарр говорит, что она тоже изначально считала, что вирус возник в лаборатории.
«Лабораторное происхождение — это возможность. Это законная возможность происхождения SARS-CoV-2, которую нужно было серьезно рассмотреть, и которую мы рассматривали», — сказал Дебарр.
По ее словам, Андерсен хорошо известен как первый «лабораторный утечки».
«Поэтому мы все были открыты для идеи утечки в лаборатории, за исключением того, что мы ученые, и мы идем туда, куда идут данные. И до сих пор все доступные данные и различные типы данных указывают в одном направлении», в сторону события, связанного с распространением информации среди животных, которое, вероятно, произошло на рынке Хуанань.
Уроки прошлых пандемий
Понимание происхождения SARS-CoV-2 чрезвычайно важно не только для понимания того, что произошло с COVID-19, но и для понимания того, как будущие пандемии могут поджидать нас.
Андерсен отметил, что после пандемии была проделана большая работа по повышению безопасности лабораторий и снижению вероятности случайного выброса опасных вирусов, однако гораздо меньше внимания уделяется торговле дикими и сельскохозяйственными животными, которая по-прежнему представляет серьезную опасность.
Получайте еженедельную рассылку CNN Health
- Зарегистрируйтесь здесь, чтобы каждую пятницу получать программу «Результаты известны» с доктором Санджаем Гуптой от команды CNN Health.
«Как много говорится о нерегулируемой торговле дикими животными, ежегодный оборот которой в Китае составляет более 50 миллиардов долларов», — сказал Андерсен.
Андерсен отмечает, что в образцах, взятых на рынке Хуанань, они также обнаружили вирус гриппа H9N2 — еще один вирус, готовый к появлению.
Он сказал, что это леденящее душу напоминание о том, что SARS-CoV-2 не был чем-то особенным, это было не обязательно. Это был просто вирус, который оказался в нужном месте в нужное время.
Тот же сценарий, что произошел в Ухане в 2019 году, может сейчас разыгрываться с вирусом птичьего гриппа H5N1 в Соединенных Штатах на птицеводческих и молочных фермах. Пока вирус распространяется, сказал он, «это игра случая».
Хотя Андерсен согласен с тем, что необходимо более строгое регулирование лабораторных исследований вирусов, по его словам, больше внимания следует уделять рынкам животных.
«У нас также есть более крупный монстр прямо перед нами — нерегулируемая торговля дикими животными», — сказал Андерсен. «И это даже не обсуждается».